除换刀程序外，加工中心的编程方法和普通数控机床相同。
不同的数控系统，其换刀程序是不相同的，通常选刀和换刀分开进行。
多数加工中心都规定了“换刀点”位置，即定距换刀。换刀程序可采用两种方法设计：
方法一：N10 G28 Z0 T02
N20 M06
方法二：N100 G01 Z30 T02
……………
N200 G28 Z0 M06
N210 G01 Z30 T05
……………
N200程序段换上N100程序段选出的T02号刀具；在换刀后，紧接着选出下次要用的T05号刀具。 在N100程序段和N210程序段执行选刀时，不占用机动时间，所以这种方法较好。
